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莫斯科物理技术学院的研究人员及其同事首次成功地使用 RNA 测序作为癌症诊断免疫组织化学的替代方法。他们的研究发表在Biomedicines上。

常规用于癌症诊断的方法依赖于肿瘤组织切片的免疫组织化学染色。它允许检测表征恶性生长的标记蛋白的存在和浓度。该过程包括将肿瘤样本浸入热石蜡中。冷却后，一块石蜡化组织被切成薄片，然后染色并用显微镜研究。由此产生的图像表明肿瘤是否是恶性的以及它的分子类型是什么。这些信息对于选择正确的疗法至关重要。

另一种方法，RNA 测序涉及确定细胞中存在的每个 RNA 的序列和分子数量。生成的数据称为转录组，反映了细胞中所有基因的活性。为了分析如此庞大的数据阵列，生物信息学家采用专门的算法并为不同的人体细胞和组织编译转录组数据库。

最近发表在《生物医学》上的论文的作者提出，RNA 测序可作为传统免疫组织化学染色的替代和补充技术。在这种方法下，可以在分析中使用相同的石蜡化肿瘤碎片。这意味着不需要额外的活检，并且这两种技术将很容易结合起来。

“我们首次表明，这两种方法的结果对于选定的一组生物标记物是完全一致的。只是免疫组织化学需要更多的实验——每个生物标记物都需要一个实验——这意味着需要更多的生物材料. 反过来，RNA 测序使我们能够定量描述所有蛋白质编码基因的工作，其中大约有 20,000 个!首席研究员 Anton Buzdin 说，他是 MIPT 转化基因组生物信息学实验室的负责人，也是 Oncobox 研究部门的负责人。

在他们的研究中，研究人员表明通过 RNA 测序测量的四种肿瘤标记基因的表达水平与免疫组织化学染色的结果之间存在明显的相关性。

“我们相信 RNA 测序在医学诊断方面有着广阔的前景。希望我们的最新研究能让这个未来更近一点，”Buzdin 补充道。

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